弗賴堡前身的兩支球隊同於1904年成立，分別是3月成立的“Freiburger Fussballverein 04”及5月成立的“FC Schwalbe Freiburg”，兩隊1912年合並成立“弗賴堡體育俱樂部”（Sportclub Freiburg），同時采納弗萊堡造幣廠的刻印獅鹫頭作爲會徽圖案。
　　球隊在兩次大戰時代經歷多次重組。自1963年德甲成立以來，弗賴堡一直都在低組別聯賽載浮載沈。球隊最佳成績，不過是1993年和2003年德乙聯賽冠軍。
　　弗賴堡於1978年升級德乙，一直保持中遊席位，於1993年獲得冠軍而升級德甲。升級首季獲得第16位，僅以得失球差壓倒同得28分的紐倫堡而免於降級。翌季成績大躍進，獲得季軍。1995年首度參戰歐洲聯盟盃，在第一圈即以兩回合累計1-2被布拉格斯拉維亞淘汰。1997年弗賴堡只能獲得第17位而降級，但翌年即奪得德乙亞軍回升德甲。再次在頂級聯賽逗留四季，成績最好是2000/01年賽季獲得第6位，再戰歐洲聯盟盃，直到第三圈才被當屆冠軍費耶諾德淘汰，需要兼顧兩條戰線的弗賴堡於2002年只能排第16位降級，翌季再奪德乙冠軍升級德甲，但這次只能在德甲兩季，於2005年排第18位降級。回降德乙兩季均只能獲得第4位而未能升級，直到08/09賽季才以德乙冠軍身份重返德甲。
　　2016/17賽季球隊的球衣贊助商是丹麥體育品牌Hummel。