非洲联盟杯分为资格赛，小组赛、淘汰赛三个阶段。资格赛分成3轮（第一轮、第二轮、附加赛），每轮都是两回合淘汰赛，两回合打平先按照客场进球规则判定，若还是平局则进行点球大战。第二轮后的16个胜者球队将于16个非洲冠军联赛资格赛第二轮的负者进行附加赛，决出16个小组赛名额。

　　小组赛阶段16支球队分成四组进行主客场双循环小组赛，每组前2名获得八强资格。淘汰赛阶段均进行主客场双回合决出胜负。两回合打平先按照客场进球规则判定，若还是平局则进行点球大战。